Meines Wissens liegt der einzige Unterschied in den Commntaries. Diese sind auf den Einzelsets nicht vorhanden.

Premiere Commentary with series creator Rockne S. O'Bannon, executive producer Brian Henson and Ben Browder
Throne For A Loss Commentary with Ben Browder and Claudia Black
I, ET Commentary with Claudia Black and Anthony Simcoe
Back And Back And Back To The Future Commentary with Ben Browder and director Rowan Woods
Exodus From Genesis Commentary with Brian Henson and Virginia Hey
Thank God It's Friday…Again Commentary with Rockne S. O'Bannon and Anthony Simcoe
Bone to Be Wild Commentary by Anthony Simcoe
Family Ties Commentary by Ben Browder and Claudia Black

Die restlichen Extras sind identisch.

Und natürlich nimmt das Komplett-Set wesentlich weniger Platz weg als die Einzelsets.