Zu 1: Ja, ich hatte mir schon gedacht, dass du es deswegen gemacht hast. Pilots Anreden sind schon etwas merkwürdig. Mal sehen, wie das die anderen sehen.

Zu 2: Ich habe jetzt gerade mal im Duden nachgesehen (hab ihn tatsächlich noch unter den ganzen Abibüchern wiedergefunden) und danach wird "Sie" immer groß geschrieben. Darunter ist sogar ein Beispiel, in dem es in einerm Dialog so verwendet wird.

Das Siezen von Katoya und die Ausnahme bei Scorpius fand ich übrigens in Ordnung.
Ist zwar ungewohnt, aber ich denke, so hätte es auch jeder andere "Fernseh-Übersetzer" gemacht.