Näher kommen sie sich in der zweiten Thrawn-Trilogie (bzw. zweite Zahn-Trilogie), also "Schatten der Vergangenheit", "Blick in die Zukunft" und "Der Zorn des Admirals".

Dort erkunden sie beiden den geheimen Zufluchtsort von Thrawn, Nirauan.

Spoiler (der komplette Rest ist spoilig):
<font class='spoiler'>Wo sie sich dann endgültigst "näher" kommen (sprich Hochzeit), ist im Comic "Star Wars Union - die Hochzeit von Luke und Mara" von Michael A. Stackpole. Das ganze spielt ein Jahr nach den Geschehnissen auf Nirauan.</font>

Das ist aber mehr das "Finale" der Beziehung. Angefangen hat das ganze in der 1. Thrawn-(/Zahn-)Trilogie, als Mara mit Luke auf Myrkr im Dschungel strandet. Mara befreit sich am Ende der Trilogie vom Fluch, Luke Skywalker täten zu müssen (sie killt seinen Klon).
Es folgen kürzere Intermezzos wie in der Jedi Academy Trilogie, aber sonst ist da nichts großartiges, weil Luke ja seine Pseudo-Beziehung mit Callista führt.