nun beim Lesen halte ich es eigentlich wie Kaff, wo es nur geht greife ich zur
Orginalliteratur

Was das Thema Shuttle angeht, würd ich eigentlich auch immer das Shuttle sagen.
Ich kann mir aber auch Situationen vorstellen wo ich der Shuttle sage, z.B. wenn
ich von einem Shuttle-Bus rede. Um das nun ganz zu klären hab ich mal auf duden.de
geschaut und siehe da (was mal halt sieht wenn man nicht bezahlt):

Shut|tle der; -s, -s [engl. (space) shuttle; engl. shuttle = im Pendelverkehr eingesetztes Fahrzeug]: 1. Raumfähre.
Quelle: www.duden.de

zum weiteren Vergleich, und mMn auch mehr Aufschluss gebend, siehe auch: dict.leo.de

Letzten Endes würde ich in der SF Literatur ein "das Shuttle" erwarten da es ja
dort meist als "das Schiffchen" zu verstehen ist. Ansonsten ist der Kontext zu
betrachten.